電子監管碼的賦碼方式，根據企業產品的特點，由企業自愿選擇。由于不同產品包裝的差異，與之對應的賦碼方式也有區別，企業可根據實際情況選擇下列合適的方式賦碼：

(一)噴印方式賦碼(變碼印刷)

對于外包裝為紙質的大部分產品，可以在具備變碼印刷能力的印刷廠，通過變碼噴印系統，將監管碼直接噴印到入網產品的包裝或標簽上，實現產品賦碼。
適合采用變碼噴印賦碼的產品類別：
1．有紙質瓶標的玻璃瓶裝產品：如醬油、紅酒、瓶裝食品等；
2．盒裝化妝品、護膚品：如香水、化妝品、護膚產品等；
3．有紙類合格證的產品：如袋裝化肥、面粉合格證等；
4．紙厚低于300g的紙盒包裝產品：如藥盒、煙盒等；
6．牛皮紙箱包裝產品：如家電、電腦等；
5．盒裝電子產品：如手機、MP3等。

(二)金屬類包材的賦碼方式

此類包裝主要以聽裝飲料、罐頭、乳粉類產品為主，可實施的賦碼方式主要有兩種：
1．應用激光、墨水噴碼機在產品上直接實現刻印(噴印)數字明碼。其特點是：滿足現代流水生產環境，無論是高速生產線或是中低速生產線都可應用。但是，只有在沒有其他賦碼方式的情況下，才采用只噴數字明碼的方式賦碼；
2．應用自動貼標機貼標。這種賦碼方式的特點是：自動化程度高，適應快速生產，可以方便的用條碼識別器來識別，是目前此類企業通常選擇的賦碼方式。

(三)塑料薄膜包裝類的熱轉印賦碼方式

對于外包裝為塑料薄膜的大部份產品(熱縮膜除外)，可以在具備熱轉印印刷能力的印刷廠的覆膜、分切、復卷等環節，通過熱轉印打印設備，將電子監管碼打印到產品的包裝或標簽上，實現入網產品賦碼，或是直接在包裝線上安裝熱轉印設備實現賦碼。
適合采用熱轉印賦碼的產品類別：
1．袋裝醫藥類產品：如鋁塑防潮包裝的藥品等；
2．袋裝化裝品、護膚品：如小袋裝洗發水、護發素等；
3．塑料袋裝農產品、種子：如種子類產品等；
4．塑料袋裝食品：如袋裝奶粉、冷凍食品等；
5．覆膜袋包裝的化肥產品：如塑料袋裝化肥類產品；
6．外包裝為塑料薄膜的大部份產品。

(四)貼標賦碼

對品種多、產量少不適合大批量印刷的產品，企業可以采用貼標方式賦碼，包括貼通用標方式和貼個性標方式。標簽制作必須嚴格遵循《電子監管碼印刷規范》。一般情況，下列包裝類型的產品適合采用貼標賦碼：
1．禮品盒類產品：如需要封口貼標的禮盒等；
2．各種包裝的酒類產品：如瓶裝、盒裝、禮品裝白酒等；
3．塑料瓶類包裝產品：如瓶裝農藥等；
4．金屬罐類產品：如罐裝奶粉、食品罐頭等；
5．硬塑料盒類產品：如光盤制品等；
6．外包裝不規則的產品：如工藝品、茶葉等。